第一、孩子自身身体的原因
小孩子抵抗力本来就不好，一旦出现感冒和消化不良、便秘时，身体的防御能力更会下降，让细菌有机可乘，从而有很多的细菌繁衍，最后引起扁桃体发炎，喉咙出现充血和化脓的状况。
第二、滥用抗生素的原因
孩子一旦患了扁桃体容易发炎，家长常有运用抗生素的习惯，孩子的病老好不了与这个习惯有着密切的关系。在日常生活中，由于担心耐药性，不少家长在给孩子用药时，并不会遵循医嘱按阶段服用抗生素医治，经常是只要炎症消失了，就会自行减药甚至停药，而这种行为最终的结果便是导致病情反反复复治不好。
第三、擅自停药会导致细菌清除不净
在对扁桃体进行治疗时，如果病情有了好转，炎症消失只能说明细菌现已降低到无法致病的程度，并不意味着细菌现已被完全清除干净，仍需持续服药医治。擅自停药会导致细菌清除不净，细菌就会隐藏在扁桃体上，构成慢性病灶。这不只会导致扁桃体反复发炎，隐藏在扁桃体上的细菌或许经过全身血液循环和淋巴液循环等途径感染肾脏、心脏等，然后诱发肾炎、心肌炎、风湿性关节炎等，对人体的损害很大。
第四、外界因素反复作用
如果生活的环境比较潮湿、或是空气不好，吸入一氧化碳等原因。另外，如果一些疾病没有治愈且反复发作，如营养不良、佝偻病、消化不良、平时缺乏锻炼、以及有过敏体质的小儿，因身体防御能力降低，当这些疾病发生后，也容易发生扁桃体炎，特别是免疫力低的孩子，扁桃体炎更易反复发作。
因而，孩子患了扁桃体炎，一定要遵循医嘱进行医治，这样才能完全杀灭细菌避免复发。另外，为预防扁桃体炎的发生，要让孩子养成良好的生活习惯，并要安排好作息时间，保证有足够的睡眠，并在气温变化时适当添加衣物。另外，要经常让孩子参加体育锻炼，以增强身体的抵抗力，一旦患上扁桃体炎，应及时进行医治。