胎停现象越来越常见，但遗憾的是，至今胚胎停育的原因尚不完全明确，科学探索的领域还是非常有限。

当然，有几种原因是比较明确的，例如:

①遗传性因素。偶发的自然流产，往往由于胚胎染色体异常，是胚胎优胜劣汰的结果。胚胎染色体异常可源自父母，也可能是胚胎的自我突变。

②生殖内分泌因素。胚胎发育早期，需要各种激素的支持。如雌激素（E）、孕激素（P）和绒毛膜促性腺激素（HCG）产生不足，就可能造成停育。

③生殖免疫因素。如果母体出现生殖免疫紊乱，比如存在自身抗体ACA等，或缺乏保护抗体APLA等，孕母的“防御体系”就会杀伤胚胎，造成胚胎停育。

④子宫的问题。若子宫内环境不好，如存在息肉、瘢痕、纵隔等，胚胎就很难正常生长。

⑤感染因素。主要指病毒等微生物感染，包括巨细胞病毒、弓形虫、风疹病毒、单纯疱疹病毒等。在早孕期，病毒易入侵胎儿，加之此时胚胎对外界因素很敏感，有可能受到致命的威胁。

此外，还有许多目前科学研究尚未发现的各种原因。