获得性免疫缺陷综合征的临床表现复杂多样，可累及各个系统，表现为机会性感染或相关肿瘤。当患者出现艾滋病典型症状时，CD4+细胞计数通常降至200/ul以下，未经治疗者在进入此期后的平均生存期为12～18个月。

常见的机会性感染包括：病毒感染，如巨细胞病毒性视网膜炎、带状疱疹（水痘带状疱疹病毒引起）、口腔毛状白斑（EB病毒引起）等；细菌感染，如结核病，鸟分枝杆菌感染等；真菌感染，如肺孢子菌肺炎（PCP）、隐球菌脑膜炎、白色念珠菌引起食道炎和口腔感染等；寄生虫感染，如弓形虫脑病、隐孢子虫引起的腹泻等。首都医科大学附属北京地坛医院皮肤性病科伦文辉

艾滋病具有代表型的常见恶性肿瘤包括非霍奇金淋巴瘤和卡波西肉瘤，肿瘤的发生也与病毒的感染相关，淋巴瘤通常与EB病毒感染相关、卡波西肉瘤（Kaposi’s sarcoma）与人类疱疹病毒8型感染相关等。