扁桃体是具有一定的免疫功能的，扁桃体、淋巴结、消化道集合淋巴小结和阑尾等均属末梢免疫器官。扁桃体生发中心含有各种吞噬细胞,同时可以制造具有天然免疫力的细胞和抗体,如T细胞、B细胞、吞噬细胞及免疫球蛋白等,它们对从血液、淋巴或其他组织侵入机体的有害物质具有积极的防御作用。出生时扁桃体尚无生发中心,随着年龄增长,免疫功能逐渐活跃,特别是3~5岁时,因接触外界变应原的机会较多,扁桃体显著增大,此时的扁桃体肥大应视为正常生理现象。过了6～8岁以后，扁桃体的免疫活动趋于减退,说的通俗一点就是“可有可无”。
那什么情况下需要切除扁桃体？
1.每年有超过3到4次的急性扁桃体发炎，病程超过两年。
2.合并2次以上的扁桃体周围炎。
3.扁桃体过度肥大，堵塞咽部导致打呼噜、呼吸不畅及发声功能。
4慢性扁桃体炎已成为引起其他脏器病变的“病灶”，如合并有风湿热、风湿性心脏病、风湿性关节炎或肾炎等疾病
5.扁桃体角化症
6.各种扁桃体良性肿瘤（如乳头状瘤、息肉），可以和扁桃体切除一起切除完整的。