对于癌症的诊断，除了病理（金标准），其余都不能保证100%准确，甲胎蛋白（AFP）也不例外。
肝癌患者当中，只有60%甲胎蛋白会升高，还有40%不升高。因此，甲胎蛋白正常不一定没有肝癌。
因为甲胎蛋白全称叫做甲种胎儿球蛋白，只在胚胎早期阶段生成。在胚胎发育过程中，原始胚胎干细胞会逐渐分化，变成成熟的组织细胞比如肝细胞。分化程度越高，越不会产生甲胎蛋白，恶性程度越低。因此，只有低分化肝癌和部分中分化肝癌产生甲胎蛋白，而高分化肝癌一般不产生甲胎蛋白。一般甲胎蛋白越高，恶性程度越高。
因此，肝癌诊断依靠病史、体检、化验、影像学等综合判断。如果有基础肝病尤其是肝硬化，需要定期筛查肝癌，除了查甲胎蛋白，还必须查肝胆彩超和PIVKA（异常凝血酶原）。PIVKA同AFP一样，是另一种肝癌特异肿瘤标记物，也不是每个肝癌患者都会升高，但两者同时查，会增加发现概率。
每个患者均有特殊性，具体病因、治疗指征和方式请咨询专科医生。
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