一些不育夫妇很关心的是试管婴儿是否与一般孩子不一样，会不会生出一个怪胎来，也就是生出畸形儿?他们往往对此非常不放心，并一再要求医生做出承诺。实际上，这对于医生来说实在有点苛求了，医学中有许多不确定因素存在，即使是没有进行试管婴儿技术而自然妊娠和分娩的后代，也不见得都是100%的健康。

　　事实上，试管婴儿出生的孩子也和正常妊娠一样，出现某些畸形也是完全可能的。但在动物身上进行的研究已经证明了，出生这种畸形后代的危险性很小。而且，近40年来的人类治疗经验，那些已经出生的试管婴儿已经用活生生的“人证”来以同样的结论回答了这个问题。由此看来，试管婴儿出生的孩子问题并不是很严重。

　　值得一提的是，个别携带遗传异常基因的夫妻，确实存在将自己的遗传异常传给后代的可能性，这在进行试管婴儿治疗之前应该接受全面的遗传学分析，并应该有专业医生进行详细的遗传咨询。

　　此外，子宫本身可以将异常胚胎以流产的形式排斥掉，我们还可以利用现代的科学技术对胚胎和胎儿进行全面检查，早期淘汰异常或畸形儿。最后，在万不得已的情况下，还可以通过产前诊断来明确胎儿的发育情况，对于确定诊断有严重“毛病”的胚胎，给予碎胎等有效地处理，主动淘汰这个“残次品”。