1.食物成分不适宜
便秘与食物的成分关系密切，如食物中蛋白质含量过多而糖类不足，使肠发酵相对减少影响发酵，使大便呈碱性，干燥导致便秘。食物（如奶粉）中含大量的酪蛋白，粪便中含多量不能溶解的钙皂致粪便增多，容易便秘。
2.长期饮食不足
小儿食量太少时，经过消化后，肠道中的余渣少，大便减少；奶中糖量不足使大便干燥；较长时间的饮食不足，致营养不良使腹肌、肠肌瘦弱，张力不足，蠕动无力，导致顽固性便秘。
3.肠功能问题
由于生活和排便不规律，排便反射形成减弱或不形成；肠肌松弛而便秘。某些能使肠壁肌张力减弱、功能失常的药物或疾病以及交感神经功能不正常均可致便秘。
4.消化道发育畸形
先天性无肛，先天性巨结肠。5.遗传代谢性疾病：先天性甲状腺功能低下，先天愚型。