因有众多健康带毒者，传播途径又复杂多样，预防腺病毒感染比较困难。
1.注意个人卫生，可减少家庭中腺病毒的粪-口传播。
2.对饮用水、游泳池进行严格消毒，则可大大降低暴发流行的危险性。
3.眼科医生应注意对流行性角膜结膜炎病人进行隔离，洗手，分开使用毛巾，对眼科应用的仪器应予以消毒处理，以预防医院交叉感染，或眼部接触传播。
4.注意减少腺病毒感染病房内医源性暴发流行的可能性。
5.托幼集体机构有腺病毒感染时，需要采取隔离措施，隔离时间应为2周以上。
6.  3、4、7型腺病毒口服活疫苗经研究有预防作用，而且重组的AdV疫苗将更是一种颇为理想的疫苗。因减毒活疫苗有致癌的可能性，应用受到限制。国外仅限定特定人群应用口服疫苗，以保特定人群免受感染。