多系统神经萎缩（MSA）是成年期发病、散发性的神经系统变性疾病，一般情况下从首发症状确诊到死亡，大约能生存1~18年不等，中位时间为6-10年，存活时间差异较大，与亚型及照护情况有关。在主要为回顾性的研究中，MSA从发病到残疾里程碑的中位时间如下：发生自主神经功能障碍，2.5年；需要使用助行器，3年；受限于轮椅代步，3.5-5年；卧床不起的状态，5-8年。MSA从发病至死亡的中位时间为6-10年。然而，存活情况的差异较大，有些MSA患者症状出现后可存活15年甚至更长时间。尤其，40岁前发病(又称青年发病型MSA)的患者生存期比通常报道的MSA生存期更长。在不同的研究中，生存期较短的危险因素包括：诊断为震颤麻痹型MSA(即MSA-P)、膀胱排空不完全、发病年龄较大、早期或严重自主神经功能衰竭、喘鸣早发、女性、从发病到首次残疾临床里程碑出现的时间较短(例如：经常摔倒、认知功能障碍、莫名其妙的言语、严重吞咽困难、依赖轮椅、需要使用尿管)。