1、遗传因素：小儿癫痫的遗传性的因素一般情况下多发生于5到15岁的儿童之间，对于小儿癫痫与遗传因素有着微妙的联系，包括儿童及少年失神性癫痫，少年肌阵挛性癫痫，儿童良性的癫痫，伴中央颞区棘波、常染色体显性遗传夜间额叶癫痫等特发性全身或局部性癫痫。如果父母患有癫痫病，那么子女患小儿癫痫病的几率可高达50%，甚至会更高，家族中有癫痫病的病史，那么下代也有可能患癫痫病的。
2、大脑先天性发育异常：在怀孕期间孕妇服用了某些刺激性比较大的药物，就会影响胎儿的大脑，出生后就有可能会患上小儿癫痫病。
3、后天大脑外伤：在平时不注意保护大脑，受到严重的外伤而破坏到大脑神经元，就会引起神经元异常放电，而导致小儿癫痫病的发生。