中华医学会外科学分会胆道学组和中国医师协会外科医师分会胆道外科医师委员会制定的2019版《胆囊癌诊断和治疗指南》提出胆囊癌的危险因素包括明确危险因素和可能危险因素。明确危险因素包括胆囊结石、胆囊息肉样病变、胆囊慢性炎症、“保胆取石”术后胆囊。本次指南首次明确把“保胆取石”术后胆囊作为胆囊癌的高危因素，认为保胆取石后的胆囊，致结石形成的危险因素和胆囊炎症未消除，“保胆取石”术是不科学不规范的治疗手段。
胆囊癌可能的危险因素包括先天性胰胆管汇合异常、胆囊腺肌症等。