卡介苗是一种减毒的活分支杆菌，最早是用来治疗结核病，后来发现对某些些肿瘤也有抗肿瘤作用，其中就包括尿路上皮癌。肾盂、输尿管和膀胱的粘膜上皮都是相同的，统称为尿路上皮癌。Brosman于1982年第一个将它用于膀胱灌注治疗膀胱肿瘤，至今在尿路上皮癌膀胱灌注治疗中是全世界公认效果最好的，它的肿瘤复发率和死亡率都是最低的。卡介苗粉剂与50毫升盐水进行混合，通过临时插入导尿管，将卡介苗液体注入到膀胱内。患者要保留药物两个小时，这期间包括平卧，俯卧，左侧卧，右侧卧各半个小时，让膀胱粘膜的各个部分都能与卡介苗相接触，也有专家认为，这种体位的改变似乎意义不是很大，存在着一定的学术争论。患者灌注以前尽量少喝水，不喝咖啡，这样尽量保证能够让卡介苗在膀胱内保留足够的两个小时。

由于卡介苗是一种减毒的活疫苗，被身体吸收后可能会产生败血症，因此要在膀胱肿瘤电切手术后2到4周的时间才开始灌注，这段时间让膀胱粘膜有一个愈合和重新上被化的过程。在少数病例中发现卡介苗有可能被膀胱内未闭合的毛细血管吸收，进入血液循环。另外有少数医生建议，病人在家里排过尿的小便池，应该用消毒水刷一下。