原创 肿瘤患者为什么做基因检测以及报告解读
2019年09月08日 【健康号】 邱立新     阅读 10039

肿瘤患者为什么做基因检测以及报告解读

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邱立新,就职于复旦大学附属肿瘤医院肿瘤内科。主要从事胃癌、肠癌等恶性肿瘤的化疗、靶向治疗、免疫治疗和研究。创办了肿瘤科普公众号“邱立新医生(qiulixinyisheng)”。


在International  Journal of Cancer、European Journal of Cancer等发表SCI论文65篇,累计影响因子约300 分,其中第一或并列第一作者SCI论文40篇,累计影响 因子约180分。副主编《赢在论文*术篇》、参编《实用循证医学方法学》。负责国家自然科学基金、中国临床肿瘤学科学基金等。获得教育部科技进步二等奖、上海市医学科技进步奖三等奖、上海医学院首届青年学者论坛二等奖等 。



有任何问题,欢迎后台留言,或者扫描下方二维码,也可直接微信搜索“qiuyisheng222”添加邱医生就可以咨询啦。



什么是基因检测?

癌细胞与正常细胞有很多不同,其中,最重要的不同是癌细胞中有不少基因是变异的,有的基因缺失了,有的基因融合了,有的基因重排了等等,利用基因检测把变异的基因找出来,然后使用靶向药物针对这个突变基因进行治疗。

什么样的肿瘤患者推荐做基因检测?

很多患者做完手术后,都会问医生,是否需要基因检测,我会回答如果经济能力许可的话,建议做基因检测,对于目前术后辅助治疗可能帮助不大,但是如果很不幸后期复发,基因检测的结果还是有帮助的

为什么这么说呢?一般来说基因检测通过两种途径,活体组织和血液。活体组织准确性高于血液。活体组织的话需要新鲜的组织检查基因突变才准确 。所谓新鲜组织,一般从体内取出后三个月内的组织。所以,手术后的病理组织做基因检测是最合适的。我们一般推荐的优劣顺序是:新鲜的组织标本(最近手术或活检新取的组织标本)>1-2年内的组织标本>最新的血标本>2年以上的旧的组织标本。如果手术后没有做基因检测,是不是就没有机会了呢?答案是NO,还是那句话,如果不幸复发,还是建议重新穿刺取病理,然后做基因及免疫检测,这个非常重要。为什么?目前的治疗是精准治疗的时代。对于驱动基因明确的肿瘤,基因检测非常重要。比如,我们目前确定有驱动基因突变的非小细胞肺癌。常规建议做EGFR、ALK、ROS1、MET等基因检测。因为针对突变基因的靶向治疗是延长生存期的一个重要的治疗方案,邱医生在前期的公众号已经详细解释过。

基因检测与靶向治疗

靶向药物疗效好,特异性也非常强,只适合有特定基因突变的人群。临床中,常听到患者说这样的一句话,“邱医生,我和张三患一样的肿瘤,它口服XX替尼效果很好,我能不能也口服试试”。邱医生斩钉截铁的回答不可以。为什么?因为张三有基因突变,你没有基因突变,它xx替尼有效,你用了非但没效,还会产生皮疹,口腔溃疡等副作用。临床中有肺癌的患者会问“邱医生,我不想做基因检测,能不能忙吃靶向药”?邱医生非常不喜欢这样的问题,记得下次一定不要问。邱医生要告诉你,为什么?首先,如果没有突变,吃了一个月后肿瘤进展耽误患者的治疗时间。其次,检测的费用两三千块钱,一个月易瑞沙的费用也要几千块钱。所以盲吃肯定是既耽误病情又不省钱。


基因检测套餐如何选?

针对市场上从几千到上万的检测套餐,患者就犯难了,这到底该怎么选?下面邱医生给大伙分析一下,举个简单的例子。1、你去餐厅点菜,菜单一上来,我们看到会有箭头的推荐菜。一般来说点推荐菜是50%以上的几率满意。如果不满意,可以再继续点其他菜。2、直接把菜单里面的十几种菜都点一遍,虽然花钱多,但是这样的话选到自己满意菜的几率也高,不需要重新再点。几千块钱的套餐就是我上面提到的推荐菜,上万的套餐就是菜单里面的菜全点一遍。一般来说,邱医生推荐后者,但是还需要根据每个患者的情况量力而行。


基因检测与化疗

乳腺癌术后辅助化疗存在争议的患者,具有如下特点:I或 II期(肿瘤直径小于5cm)、ER/PR阳性、HER2阴性、淋巴结转移阴性。乳腺癌21基因检测复发分数(RS)<18,复发风险较低,18<RS<31,复发中风险, RS>31复发高风险。只有高复发风险患者才需要化疗。化疗药物与基因检测1、伊立替康   UGT1AI突变和杂合型使用伊立替康可产生致死性腹泻可能,此类患者应慎用伊立替康。2、吉西他滨与顺铂  ERCC1与顺铂活性呈负相关,RRM1与吉西他滨活性呈负相关。吉西他滨联合顺铂(GP)方案的疗效与ERCC1和RRM1两个基因表达呈负相关性,也就是说如果这两个基因表达比较高不建议使用GP方案。3、紫杉醇与长春新碱  低TUBB3表达水平的肿瘤患者接受紫杉醇或长春新碱的疗效较好,反之,则较差。4、依托泊苷  高表达的TOP2A 使用依托泊苷效果较好,低表达的TOP2A对依托泊苷耐药。


治疗一段时间后,要不要重新做检测?

很多患者使用靶向药,刚开始的时候效果很好,后来慢慢效果减弱,最后出现耐药,这个时候建议重新穿刺取病理或者血液做基因检测,目的是找到耐药基因,针对耐药基因进行治疗。比如肺癌EGFR突变的患者,使用吉非替尼效果 较好,后出现T790M突变,更换奥西替尼效果可。


用PD-1抑制剂,为什么要做基因检测?

1) 携带JAK1、JAK2、BM2、HLA、STK11等基因突变的患者,可能对PD-1抑制剂天然耐药。

2) 伴有MDM2/MDM4扩增、EGFR突变,使用PD-1抑制剂,可能发生爆发进展。

3) MSI-H (微卫星高度不稳定)的患者或dMMR(错配修复基因缺失)的患者可以使用PD-1抑制剂,效果好。

4)携带POLE / POLD1基因突变的患者,使用PD-1抑制剂,疗效较好。


做基因检测可以筛查家族遗传疾病

好莱坞影星安吉丽娜·朱莉的母亲和姨妈因乳腺癌去世。2013年她本人通过基因检测得知,自己遗传携带了肿瘤易感基因BRCA1,使得她患乳腺癌及卵巢癌几率高达87%和50%。2014年4月和2015年3月接受了双侧乳腺切除手术和卵巢切除手术来预防肿瘤的发生。

林奇综合征又称遗传性非息肉病性大肠癌,本质在于MLH1、 MSH2、MSH6、 PMS2四个基因的遗传缺陷,基因诊断已成为林奇综合征的“金标准”。

遗传性息肉病性结直肠癌综合征:可以做APC基因检测帮助判断。

遗传性弥漫性胃癌综合征:该综合征与CDH1基因突变有关,其中男性患弥漫性胃癌的风险约为67%,女性约为83%。

遗传性乳腺癌-卵巢癌综合征:与HBOCS与BRCA1/2基因突变有关。

黑斑息肉综合征:与PJS与STK11基因突变有关。



所有靶向药使用前必须做基因检测吗?


目前临床上的靶向药可以分为两类:特异性靶向药和广谱性靶向药。特异性靶向药可以理解为一把钥匙开一把锁,必须要做基因检测,配对合适才能使用。广谱性靶向药可以理解为进入一个房间只要有钥匙就可以,不管是张三的钥匙还是李四的钥匙,不需要做基因检测。而广谱性靶向药目前上市的药物主要针对抗肿瘤血管生成这条通路,每个肿瘤都有不同的靶向药,比如肺癌使用安罗替尼,胃癌使用阿帕替尼,肠癌使用呋喹替尼

有基因突变,一定有靶向药可用?

不是。基因突变的类型太多,绝大多数基因突变,目前无法明确是不是和肿瘤有关;大多数能明确和肿瘤一定相关的基因突变(比如KRAS突变、P53突变、MYC扩增等),目前尚无已经上市的靶向药。但是,目前很多已经进入临床试验阶段,如有需要,请在公众号后面留言。


基因检测结果,到底怎么看?


基因结果如果看,只要抓住下面三条就可以


我的基因检测结果是阴性还是阳性?

 是哪一个基因产生了突变?

 这个基因目前有可用的靶向药物吗?



举个例子,这个是某个患者的基因检测目录,我们需要看的是头色边框标注的内容

目录Contents 目录


1、样本信息---------------------------------------------------------------------------------------------------1


2、检测项目---------------------------------------------------------------------------------------------------1


3、检测结果及用药提示---------------------------------------------------------------------------------------2


3.1关键信息摘要---------------------------------------------------------------------------------------------2


3.2靶向药物用药提示----------------------------------------------------------------------------------------3


3.2.1用药相关的基因突变-----------------------------------------------------------------------------------3


3.2.2未知临床意义的基因突变-------------------------------------------------------------------------------6


4、预后相关基因提示------------------------------------------------------------------------------------------7


5、现有临床试验参考------------------------------------------------------------------------------------------8


6、样本质控---------------------------------------------------------------------------------------------------13


7、说明-------------------------------------------------------------------------------------------------------15


8、基因检测结果解析-----------------------------------------------------------------------------------------16


9、附录-------------------------------------------------------------------------------------------------------21





检测项目


检测范围:本产品对与肺癌NCCN指南建议检测的9个靶向药物相关基因进行高通量测序,检测突变形式为点突变(SNV)、小片段插入缺失(INDEL)、拷贝数变异(CNV)以及融合(FUSION)。





检测结果及用药提示



检出变异情况:


1个基因突变


癌种

   

检测基因

   

热点突变

   

检测结果

   

非小细胞肺癌

   

ALK

   

基因重排;点突变(L1152/C1156/F1174/I1171/L

   

未见突变

   

1196/G1202/S1206等)

   

非小细胞肺癌

   

BRAF

   

V600E

   

未见突变

   

第18/19/20/21外显子突变(L858R/G719X/S768

   

非小细胞肺癌

   

EGFR

   

I/T790M/C797S/L861Q/L718Q/19外显子缺失突

   

未见突变

   

变/20外显子插入等)

   

非小细胞肺癌

   

ERBB2

   

20外显子插入突变;拷贝数扩增等

   

未见突变

   

HER2

   

非小细胞肺癌

   

KRAS

   

第2/3/4外显子激活突变(G12X/G13X/A59G/Q61

   

KRAS p.G12V

   

X/K117N/A146X等)

   

非小细胞肺癌

   

MET

   

14外显子跳跃突变;拷贝数扩增等

   

未见突变

   

非小细胞肺癌

   

NTRK

   

基因重排(MPRIP-NTRK1;CD74-NTRK1等);点

   

未见突变

   

突变

   

非小细胞肺癌

   

RET

   

基因重排(KIF5B-RET;CCDC6-RET;TRIM33-RE

   

未见突变

   

T;NCOA4-RET等)

   

非小细胞肺癌

   

ROS1

   

基因重排;点突变(G2032/D2033/L2155等)

   

未见突变

   


靶向用药提示解读:

         

FDA/NMPA批准用于本癌种的治疗方案:


NCCN指南推荐的用于本癌种的治疗方案:


临床研究阶段的治疗方案:Abemaciclib(III);索拉非尼(II);曲美替尼联合多西他赛(I);曲美替尼联合培美曲塞(I);


RO5126766 (I);阿特珠单抗;纳武利尤单抗;帕博利珠单抗;Ridaforolimus(II)可能耐药的药物:吉非替尼;厄洛替尼;阿法替尼;埃克替尼;达可替尼 ;奥希替尼


其他药物推荐:


卡铂+紫杉醇+贝伐珠单抗;重组人血管内皮抑制素联合长春瑞滨和顺铂;雷莫卢单抗联合多西他赛;安罗替尼



总结一下:找到有突变的基因,然后查找目前有无合适的靶向药,如果有,靶向药物治疗。如果没有,看目前有无针对这个突变基因的临床试验,如果有,可以参加。




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