原核生物能够自身复制增殖，而支原体属于最小的原核生物。支原体属于柔膜细胞类，缺乏细胞壁，不能被革兰氏染色，有一个末端的粘附结构，可以帮助它们粘附在上皮细胞上。
1980年第一次在一个尿道炎的患者中描述了生殖支原体，后来许多证据都证明了它可以造成非淋菌性尿道炎。多数患者都是有尿道症状，大约25%可以没有任何尿道炎的症状。当生殖支原体进入细胞内的时候就会形成慢性感染，因为此时它已经可以可以躲避免疫杀伤和抗生素了。在慢性尿道炎中，生殖器支原体感染占了百分之12到41%。生殖器支原体的培养非常困难，主要是通过聚合酶链反应的和扩增来诊断。
其它种类的柔膜细菌还包括解脲支原体和微小支原体。解脲支原体是不是非淋菌性尿道炎的病因在学术界有争论。国外曾经对329例有症状性的尿道炎和无症状的正常对照组进行了比较研究，结果在正常人当中发现了要比患者组多的解脲支原体和微小支原体。