抗癌登月助推中国TMB标准化
2020年10月27日 【健康号】 动脉网

抗癌登月——国内首个肿瘤精准医学大数据平台,以“链接数据,智慧抗癌”为宗旨,致力于建立下一代肿瘤病理规范化诊断标准体系。

日前,由国家癌症中心中国医科院肿瘤医院、中国食品药品检定研究院和中国抗癌协会等单位发起的中国肿瘤突变负荷(TMB)标准化项目(抗癌登月公众 号:https://mp.wei xin.qq.com/mp/profile_ext?action=home&__biz=MzU1MzY3MzE5OA==&scene=124#wechat_redirect)正式启动,旨在全面评估TMB临床检测能力并建立相关标准,积累中国肿瘤患者人群的真实世界研究数据,为NGS的临床规范应用提供数据支撑。

中国TMB标准化项目相比于美国及欧洲的两个组织FOCR和QuiP的项目来说,是目前全球范围内规模最大的TMB标准化项目,参与单位多达60家产业机构和10家医疗机构。志诺维思作为本项目唯一的独立数据分析与评估机构,发挥多年来积累的病理大数据多中心临床研究项目经验,运用其搭建的基于多模态人工智能技术的抗癌登月平台(抗癌登月官网:https://www.0cancer.cn/),助推中国TMB标准化项目。

TMB的英文全称为 Tumour Mutation Burden,中文译为肿瘤突变负荷,一般指每百万碱基检测出的体细胞突变总数,是一种反映肿瘤细胞中所含有的突变数量的生物标志物(Biomarker)。在临床上,TMB已于2019年被写入非小细胞癌美国国立综合癌症网络(National Comprehensive Cancer Network:NCCN)指南,作为肿瘤免疫治疗辅助诊断的标志物之一。2020年6月16日,美国FDA正式批准TMB作为一种跨癌种肿瘤免疫治疗的伴随诊断标记物,用于指导晚期肿瘤患者的免疫治疗用药。

TMB检测主要有两种方式,一种是TMB检测的“金标准”,即高深度的人类全外显子组测序(Whole Exome Sequencing, WES);另一种是1Mb的目标区域测序检测或检测基因数超过300个的肿瘤二代测序(Next Generation Sequencing, NGS),俗称“大panel”检测。这两种检测产品检测内容丰富、实验流程复杂、分析解读难度高,相应的市场价格也较高,因此对于晚期肿瘤患者来说TMB检测是一个昂贵的检测项目。能否从昂贵的TMB检测中得到精准的临床建议,取决于检测实验的质量、分析的精确度、解读的准确性以及实验报告周期等众多因素,同时也取决于患者与临床获益基线的比较。但目前国内不论是TMB检测或大panel检测的质量评估标准,还是各癌种的TMB临床获益基线,都几乎处于空白状态。中国TMB标准化项目的目标就是要解决这两个关键性问题,建立TMB检测统一评估规范和标准。

抗癌登月——国内首个肿瘤精准医学大数据平台,以“链接数据,智慧抗癌”为宗旨,致力于建立下一代肿瘤病理规范化诊断标准体系。2016年抗癌登月平台曾受到时任副总理的张高丽[1]的关注;2018年,抗癌登月平台支持抗癌协会病理专业委员会发起“中国肿瘤病理大数据多中心研究”项目,旨在收集中国十大恶性肿瘤的病理诊断数据,通过大数据分析来构建下一代病理诊断结构化报告规范体系(2018动脉网新闻:“抗癌登月”提升肿瘤病理规范化,志诺维思助力肿瘤迈向精准医疗时代:https://vcbeat.top/NmRiMzJjY2M1YzYxZjU3ODg0ZjI4MWQzMWM1YjY5MDY=)。事实上,通过两年多的努力,抗癌登月平台已经协助抗癌协会病理专业委员会已经顺利地完成了此项目。基于本项目的成果,抗癌协会病理专业委员会将在2020年11月14日的中国肿瘤学大会[2]上发布《下一代病理诊断结构化报告规范体系2020版》并启动该体系的全面落地工作。

抗癌登月视频

https://vcbeat.top/upload/video/02/10/27/45/1603766757654018.mp4

图注:该视频是以2017年启动的肝癌病理大数据多中心研究为背景拍摄的,事实上抗癌登月已经支持抗癌协会病理专业委员会完成多个癌肿的数据收集和科研分析工作。

抗癌登月平台发起人、志诺维思CEO/CSO凌少平博士[3]表示:中国TMB标准化项目,是抗癌登月平台支持抗癌协会病理专委会开展分子病理规范化工作中最重要的项目。该项目由国家癌症中心中国医科院肿瘤医院、中国药品食品检验研究院与抗癌协会病理专委会联合发起,志诺维思作为唯一独立数据分析与评估机构,运用其多中心真实世界研究(RWS)项目的组织和实施经验,按照项目工作组专家制订的原则和标准来完成项目中的数据分析与相关评估工作;同时,志诺维思将运用其独有的多模态人工智能技术体系,在抗癌登月上搭建可复用的评估体系,包括:肿瘤基因检测分析评估平台(Cancer Genome Testing Analysis:CGTA)和多中心科研协作及表型组数据分析平台(Intelligent Phenome Cloud: IPC),如图一。体系搭建完成后,CGTA将持续为TMB检测(或大Panel)产品提供可复用的标准化分析评估流程;IPC将助力多中心研究构建TMB或其他潜在Biomarker的药物疗效获益基线或预测模型,同时也为临床医生指导肿瘤患者精准使用免疫药物提供数据支撑。

不论是医院、临检机构、药企,还是相关评审机构都可以借助CGTA平台对目标TMB检测产品(肿瘤大panel或WES)进行包括目标区域模拟数据评估、TMB一致性评估、驱动基因准确性评估等一系列的检测能力评估。这对于肿瘤NGS检测实验室自建项目(LDT)或体外诊断试剂盒(IVD)的研发、注册申报、转产及临床生产中的质控都具有重要的意义。

抗癌登月所搭建的多中心RWS协作及表型组数据分析平台(IPC),已经协助抗癌协会的研究者开展了肝癌、肺癌等多个RWS项目。在中国TMB标准化项目中,第二阶段的RWS更关注肿瘤免疫治疗的疗效预测模型和可能的TMB获益基线。平台不但会为项目提供信息发布的服务,每一个参与的研究机构都能实时地了解项目的进展和展开学术讨论,更重要的是各单位还可查看本中心的数据并进行相关数据分析。

在项目启动会后,中国抗癌协会病理专业委员会主委杜祥教授在接受采访时表示:肿瘤精准医学的发展离不开病理诊断水平的提升,我们很高兴“抗癌登月”这样的AI和大数据平台能助推“中国TMB标准化项目”,协助病理领域建立分子病理诊断中亟待规范的基于NGS技术的分子诊断标准。在过去的三年里,抗癌登月平台伴随我们一直从肝癌、肺癌、鼻咽癌到目前的十大癌肿的病理诊断结构化报告规范的建立,我们深深感受到大数据和AI技术对于病理学科发展的赋能和助力。我期待这一次的TMB标准化项目的进展,也相信抗癌登月平台能够做好技术和数据的支撑。

相信在国家癌症中心、中检院和抗癌协会病理专业委员会的指导下,抗癌登月平台将推进NGS检测尤其是大Panel临床应用标准的建立,搭建开放的真实世界研究协作网络,加快对于肿瘤免疫治疗的疗效预测模型的研究,积累TMB或可能的Biomarker对于疗效预测的临床证据,建立肿瘤精准医疗的大数据支撑体系,推进国内肿瘤精准医疗产学研互动发展。

以下为相关链接地址:

[1] 张高丽副总理的新闻链接:http://www.kejixun.com/article/161017/235680.shtml

[2] 中国肿瘤学大会:https://www.sohu.com/a/422462971_120057660

[3] Linkedin 链接:https://cn.linkedin.com/in/shaoping-ling-6a981751/zh-cn?trk=people-guest_people_search-card


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