在儿童时期，房间隔缺损可能不会引起明显的症状，表现为无症状或仅轻微症状。随着年龄的增长，可能会出现活动后心悸、乏力、疲劳等症状。在青年时期，多数会出现活动后心悸、乏力等。

岁以后多数病人症状会加重，具体表现为患者在操持家务、快步行走、慢跑、上楼等活动时，出现呼吸困难，这是其主要表现,可出现房型早搏、房性心动过速等，特别是出现心房颤动、心房扑动等心律失常和充血性心衰的表现。

此外，如果房间隔缺损严重，还可能引起右向左分流，造成紫绀等症状。如果伴有二尖瓣关闭不全，早期可出现心力衰竭及肺动脉高压等症状，这些症状可能会因人而异。