本病病因不明。往往突然发生，现代医学研究，取斑秃局部组织发现毛囊周围有淋巴细胞浸润，但是否与炎症刺激有关，目前还没有定论；斑秃有时合并其他自身免疫性疾病（如白癜风、特应性皮炎）；斑秃有时在突然惊吓、焦虑、大怒、紧张等之后发生，有人考虑与局部神经功能障碍，血管痉挛，导致局部血运营养障碍，头发失于营养，根基不牢而脱落。遗传素质也是一个重要因素，可能与HLAⅡ型相关，25%的病例有家族史；另外，头皮穿凿性脓肿，毛囊破坏，也会导致毛发永久性脱落；再有就是真菌感染，比如黄癣，白癣等也会导致毛发脱落。