不要试图用双氧水灭菌，双氧水灭菌的同时所造成的组织坏死会给患者的伤口愈合及后续处理造成很大的麻烦。
      
双氧水冲洗伤口所造成的困惑在于有些手术中可以使用，比如断指再植手术，清创后用双氧水灭菌，而后去除过度氧化的组织，得到无菌伤口，重建修复，然后伤口一期闭合。其它情况下使用要慎重。
        
还有一些情况下术中使用双氧水，所利用的效应主要是止血而非抗菌消炎，主要用于大创面，比如髋关节返修手术和大创面肉芽清理后的止血、植皮。机理是使小血管在强氧化烧灼下，蛋白变性自动止血，相当于上万个电刀作用。