患者可根据自身心理发展方向和家属的意见进行取舍，如选择成为男性，那么就可以选择手术切除卵巢组织、输卵管、子宫和增大的乳房等女性有关的，对于阴道可不予处理。
如果选择成为女性，那么就可以选择手术摘除睾丸组织，阴蒂肥大可进行修复术。患者年龄到青春阶段后再根据男女性别采用性激素治疗。
假两性畸形
（1）男性假两性畸形
此类患者在2～3岁年龄小时选择性别最好，通常有男性外生殖器型的话最好选作男性，这时候只需要做性阴茎矫直和尿道成形术就行。对于似男非男型的患者要根据阴茎和睾丸的发育情况、心理发展方向、患者家属及其自身愿望来决定选择哪方。睾丸女性化型患者的社会性别大多是女性，乳房已发育，这时候可以进行两侧睾丸切除并作阴道成形术。
（2）女性假两性畸形
对于此类患者可以采用糖皮质激素终身替代治疗，选择相应剂量用来维持24小时尿-17酮类固醇在正常水平，此类治疗方法可以促进月经发生，乳房有所发育，减少身体体毛，使皮肤更加细腻、面部更加清秀等。对于阴蒂肥大的情况可进行阴蒂阴唇整复术或者阴道外口增宽术等等。