天然的和化学合成的采用工艺不同，但是有效成分均是维生素A和维生素D，不过也有着很大的不同。

1、含量配比不同西安市儿童医院胸外科卞军

天然提取的鱼肝油中维生素A和维生素D的比例是10:1

化学合成的维生素AD中的维生素A和维生素D的比例是3:1

（中国居民膳食营养素参考摄入量）中明确了0-3岁婴幼儿每日维生素A和维生素D的比例是3:1，所以化学合成的维生素AD更适合婴幼儿的服用。

服用配比不合理的会导致维生素D的摄入不足或维生素A的摄入过量

2、口味不同

天然提取的鱼肝油是从海洋鱼类肝脏中提取的，鱼腥味较重，婴幼儿服用依从性较差

化学合成的选用植物油、花生油作为溶剂，淡淡的食用油味道，更符合婴幼儿的味蕾。

3、安全风险不同

随着近年海洋污染问题的严重性，很多重金属（如铅、镉等）在鱼的肝脏中蓄积，可能存在重金属超标的风险，婴幼儿长期服用，存在一定的风险，此外婴幼儿自身免疫系统功能不够完善，与成年人相比，易发生湿疹等过敏性疾病，服用鱼肝油增加了过敏的风险。