治疗肛门湿疹暂时没有特效药，但是患者只要积极针对性正确用药治疗，就能取得非常好的治疗效果，因为肛门湿疹这种疾病有急性和慢性之分，所以说用药方式也很不一样。
一般处于急性期间的时候，患者应该5%硼酸溶液、5%醋酸铅溶液局部湿敷，出现糜烂结痂症状的时候可以用硼酸氧化锌膏外敷，然后局部使用肤轻松、强的松龙以及皮炎平软膏进行治疗，就能取得很好治疗效果，必要时可以结合口服抗组胺药物一起治疗，多途径综合用药治疗效果更突出一些。
患者病情处于慢性期间应该及时采用5%糠馏油软膏、水杨酸雷琐辛软膏、肤轻松软膏涂抹局部，而且服用养血祛风、除湿止痒的中药一起调理效果更好。
肛门湿疹治疗期间注意事项
1、居住环境以简洁、自然为原则。像装修房间的气味、新家具的气味、鲜花的香味、杀虫剂、香水、空气清新剂等散发在空气中，容易诱发湿疹，所以需要注意。另外，患者的随身衣物一定要勤更换，保持干净。
2、在饮食方面，患者应该戒烟酒、尽量避免食用辛辣刺激食物及鱼、虾、蟹、羊肉、鲜蘑菇、韭菜等。等到病情康复后，可以适量吃一些，但要清楚哪些食物可以导致自己发生过敏。
3、湿疹患者在洗澡方面也是有讲究的，像急性期的肛门湿疹是不能洗澡的，过渡期，可以洗，但是不能用热水，烫洗也是一种刺激，会加重病情，另外在干燥的季节，不要经常洗澡，一周一两次就行。不要使用那些碱性大的洗漱产品。
4、湿疹患者所使用的衣物、床单等最好是纯棉或丝质，像化纤、皮毛织品容易对皮肤产生刺激。衣服最好是宽松一些的，不要太紧，以免摩擦产生刺激。
5、一旦患病更加要注意做好防治，首先就是禁止搔抓，搔抓是湿疹的禁忌，属于恶性刺激，会加重病情；不要自己盲目用药，以免刺激皮肤，加重病情。