1、出血：由于术中输尿管损伤所致，一般较轻，不需特殊处理。如果出血严重，必要时行介入治疗或开放手术。

2、黏膜撕裂和黏膜下假道形成：可引起输尿管缺血致术后管腔狭窄，一般较轻，可置管保守处理。

3、穿孔：输尿管穿孔常由于导管、导丝损伤所致。一般置管引流可解决问题。穿孔后的处理最重要的是保持输尿管的引流通畅，避免尿性囊肿形成。上海市嘉定区中心医院泌尿外科朱开常

4、黏膜撕脱或套叠、断裂：黏膜撕脱和套叠是输尿管镜术最严重的并发症。小的黏膜撕脱可先作保守处理。如范围较大，应马上开放手术，视损伤部位和长度采用输尿管膀胱吻合或肠代输尿管。

5、尿源性感染：最严重者为尿源性脓毒血症。术前严格控制尿路感染，术中减压操作，术后积极监测感染相关指标和积极抗感染治疗是有效的应对措施。