目前缺乏确切而有效的治疗慢性意识障碍方法。当前临床应用的主要方法有药物治疗、物理疗法、电刺激疗法（神经调控）。
在药物方面，目前尚无足够的证据支持使用药物能提高慢性意识障碍患者的意识水平。报道一些药物可在慢性意识障碍患者身上观察到暂时或长期的改善。
金刚烷胺(多巴胺受体激动剂和NMDA拮抗剂)，一个大型II类随机对照试验证明其可加速外伤后慢性意识障碍患者的意识恢复。
唑吡坦(非苯二氮GABA受体激动剂)是一种催眠药，对部分慢性意识障碍患者可改善意识和恢复功能。
以上两种药物通过调节中央环路促进意识的复苏，金刚烷胺的临床改善与额顶叶脑代谢的增加有关，唑吡坦可能通过抑制苍白球而产生广泛兴奋。
鞘内巴氯芬(GABA受体激动剂)主要用于痉挛的治疗，但在少数非对照研究和病例报告中被作为一种潜在的促进意识恢复的药物。
其他报道对慢性意识障碍意识有改善作用的药物包括溴隐亭、左旋多巴、咪达唑仑、莫达非尼和纳美芬等。
哌甲酯、拉莫三嗪、舍曲林和阿米替林等更适用于脑损伤但意识仍存在的患者，可分别产生短或长期效应以改善注意力缺陷。