根管治疗已经是较成熟的治疗方式，但在治疗过程中仍难以完全避免并发症。主要给大家介绍三个较严重的并发症，根管遗漏、器械折断及根管侧穿。具体如下：
1、根管遗漏：遗漏的根管没有进行治疗，在遗漏根管内仍然存留部分牙髓组织及大量细菌，引起根尖周病变，导致根管治疗的失败。在牙齿萌出后，随着年龄的增长，会有增龄性的变化，同时牙齿在口腔中会受到各种理化刺激及微生物的侵袭，这些都可引起牙髓的变性、钙化，进而导致根管变细，髓腔变窄。有些细窄的根管，根管口会被钙化物覆盖、堵塞，导致在根管治疗时，医生可能会遗漏根管。牙齿的解剖结构千变万化，这也是导致根管遗漏的原因。随着根管显微镜及口腔锥形束CT的使用，医生可更全面、更清晰的了解患牙的解剖形态，减少遗漏根管的发生；
2、器械折断：在进行根管治疗时，会用到多种根管挫对根管进行疏通、扩大，根管过于弯曲、狭窄、根管壁不光滑及器械的疲劳都可能导致在治疗过程中根管锉折断在根管内，折断的器械卡在根管里，阻碍下段根管的治疗，导致根管治疗的失败。有的患者会担心折断的器械是否会随着血流进入身体的其它地方，其实折断的器械大多数会被限制在牙齿内，有极少数折断器械会超出根尖孔进入根尖周的组织中。若引起根尖周的病变，需根尖手术予以取出，尽管如此，折断器械仍被限制在牙槽骨内，不会随着血流游走到身体的其它部位；
3、根管侧穿：指根管治疗中穿通根管侧壁，导致根管系统与牙周组织相连通，封闭性破坏。通常见于牙根弯曲狭窄，根管壁过薄的根管，随着镍钛旋转器械的普及，柔韧性更好的镍钛器械更加顺应根管的原始形态，根管侧穿的情况也逐渐减少。目前根管侧穿则更多见于根管内阻塞物的取出，钙化根管的寻找及疏通等复杂治疗中，MTA(根管充填剂)及其它的生物陶瓷材料的出现，可及时对侧穿的根管壁进行修补。
尽管对于根管治疗中的并发症，目前已有应对的方法，但每年仍然有大量的患牙因为根管治疗失败而被拔除。因此，每日要做好口腔卫生维护，定期检查，做到疾病的早发现，早治疗，不要让病变进展到需要根管治疗的地步。