几种常用的结核病诊断方法
TST：作为结核病筛查试验，TST已经有100多年的历史，但其敏感性、特异性都不高，当患者处于严重疾病状态或免疫抑制状态（例如HIV感染）时易出现假阴性结果，而当患者接受卡介苗（BCG）接种或感染非结核分枝杆菌（NTM）时，易出现假阳性结果。
IGRAs：无论T-SPOT.TB还是QFT，敏感性和特异性都较好，但2014年中国学者进行的一项关于IGRAs对儿童结核病患者诊断影响因素的研究显示，IGRAs可用于筛查和发现高危人群，但不能直接作为诊断或排除结核病的依据。与TST一样，IGRAs不能区分活动性与潜伏结核感染，不能在免疫抑制人群中排除活动性或潜伏结核感染，不能区分新近或既往感染，不用被作为评价治疗效果的工具，但其可以区分BCG、NTM感染和真正的结核病。
XpertMTB/RIF：为半巢式实时荧光PCR技术，痰液检测下限为50~165CFU/ml，仅需1小时45分钟即可明确是否为结核病以及是否耐药，涂阴痰标本灵敏度为60%~80%。在肺结核病中，其敏感性超过80%，但在肺外结核病和儿童结核病中，其敏感性仅为50%左右。
新一代超敏XpertMTB/RIFUltra：痰液检测下限为5~25CFU/ml，对于涂阴痰标本，1份痰标本的灵敏度可以达到94%，且利福平耐药特异性提高。在肺外结核病和儿童结核病中，其诊断阳性率能够达到85%左右。对于菌量特别少的无菌体液或无菌器官，XpertMTB/RIFUltra诊断结核病敏感性非常高，尤其对于儿童可以作为结核病诊断金标准。对于成人结核病，XpertMTB/RIFUltra可能出现假阳性结果，例如既往结核感染，仍然可呈现阳性结果，因此，在成人中并未推广这一检测。对于结核性脑膜炎，痰涂片诊断阳性率为5%，痰培养为15%，XpertMTB/RIF为35%，而XpertMTB/RIFUltra能够达到80%，在儿童结核性脑膜炎中更可以达到90%左右的诊断阳性率。因此，对于中枢神经系统感染，此方法值得推荐。
培养与测序同时进行：有很多产品可以同时进行结核菌培养和测序。结核菌耐药位点并不多，美国疾病预防与控制中心（CDC）检测结果显示，在9个位点上发现其对7类药物存在耐药突变。
测序技术：理论上讲，一代测序对已知靶点的检测敏感型更好。二代测序（NGS）技术主要用于检出未知病原体、未知突变位点以及菌株谱系检测，对于结核病诊断，NGS技术敏感性不高，目前主要用于结核菌耐药情况检测和监测。以表型检测为参考，测序对利福平耐药的敏感性为91%，异烟肼为86%，吡嗪酰胺为54%，氧氟沙星为85%，莫西沙星为88%。总体而言，测序技术能预测85%的耐多药结核（MDR-TB）和74%的泛耐药结核（XDR-TB）。
全基因组测序（WGS）技术：发表于《新英格兰医学杂志》上的一项研究，通过检测10209个分离株，对WGS能否准确预测一线抗结核药物的敏感性进行评估。结果显示，WGS对异烟肼、利福平、乙胺丁醇和吡嗪酰胺耐药率低的预测敏感性分别为97.1%、97.5%、94.6%和91.3%，特异性分别为99.0%、98.8%、93.6%和96.8%。当然，需要注意的是，WGS技术是建立在结核菌培养基础之上的。
新皮试试验：近年来，中国学者将ESAT-6和CFP-10融合成为一种新的结核皮试试验（EC皮试）。研究结果显示，在未接种BCG人群中，EC皮试与TST和QFT结果相近，但在接种BCG人群中，TST与EC皮试和QFT差别比较大，说明TST存在较多假阳性。