胱氨酸结石有很高的复发率，饮食控制与药物治疗相结合有利于减少胱氨酸结石的复发。由于胱氨酸结石的形成在很大程度上是由尿液中胱氨酸浓度高造成的，因此对于胱氨酸结石患者，增加更多的液体摄入尤为重要。

由于需要将尿胱氨酸浓度降低到250 mg/L以下，因此尿量目标通常高于其他类型结石患者的推荐量（2500ml/24小时），而达到这一目标通常需要每天至少口服4000ml液体。

饮食中低钠的摄入已经被证明可以减少尿胱氨酸的排泄，对于胱氨酸尿病患者，合理的钠摄入量目标是每天2300mg或更少。限制动物蛋白的摄入也可以减少尿胱氨酸的排泄。增加水果和蔬菜的摄入，促进尿液碱化，有利于减少尿胱氨酸的排泄。