疼痛是泌尿及男性生殖系疾患的常见症状。为了明确诊断，应注意进行详细的病史采集和体格检查。特别应弄清楚疼痛的发生部位、性质、程度，有无放射性疼痛、放射至何部位，有无其它伴随症状等。

肾脏疾患引起的腰痛或上腹疼痛可表现为隐性的钝痛或胀痛（如肿瘤、肾积水等），也可表现为尖锐的剧痛（如肾脏或肾周的急性化脓性感染；晚期肾肿瘤的肿瘤组织侵袭肾门附近的神经根；游走肾等发生的急性肾蒂扭转等）。各种疾病导致的急性肾盂和输尿管梗阻并引起痉挛表现为绞痛。例如，结石或血块沿输尿管向下移动时可引起剧烈绞痛，并可向下腹、会阴、大腿内侧等部位放射，临床上称为肾绞痛。还有一种肾区疼痛称为反射性疼痛，肾脏本身并无疾患，而是由其他部位疾病通过神经反射造成的疼痛感觉（如前列腺疾患、外阴疾患、女性盆腔器官疾患等）。此外，一侧肾脏疾患亦可通过肾-肾反射引起对侧肾区疼痛。北京大学人民医院泌尿外科徐涛

膀胱疾病引起的疼痛症状一般局限位于耻骨上区，性质多为隐痛或胀痛，可由炎症、结石、梗阻、膀胱过度膨胀等引起。如膀胱炎症波及膀胱壁的粘膜下层或肌层时可引起严重的疼痛（如间质性膀胱炎、严重的结核性膀胱炎等）。此外，膀胱肿瘤晚期或位于尿道内口附近的肿瘤，除存在严重的疼痛不适外，还常常合并尿频、尿急及排尿困难，有时疼痛会放射至阴茎头部。

尿道、前列腺、精囊等器官常因急慢性炎症、结石、尿道狭窄、前列腺炎及精囊炎等表现为不同特点的疼痛症状。一般情况下，尿道疼痛的定位比较明确，前列腺和精囊的疼痛多不易定位，还可伴放射性痛。睾丸的急、慢性炎症、外伤、肿瘤、扭转及精索静脉曲张等常导致睾丸及附近部位的疼痛症状。其中急性附睾炎、睾丸炎、急性睾丸扭转、外伤等的疼痛一般比较剧烈，而精索静脉曲张引起的坠胀疼痛不会非常严重，睾丸肿瘤在早期一般不伴疼痛症状。