房颤的药物治疗包括转复窦性心律和控制心率。虽然国外研究显示转复窦性心律和控制房颤心率，患者愈后差别不大，但恢复窦律可缓解患者症状，避免抗凝出血风险，所以恢复窦律仍是首先的结果，房颤发作不超过48小时复律前不需抗凝治疗，超过48小时，需抗凝3周后转复，转复药包括可达龙（胺碘酮）、心律平（普罗帕酮）、倍他乐克，静脉转复药物为伊步利特。转复后继续抗凝4周，并继续服用维持窦律药物，药物包括可达龙、心律平、倍他乐克。也可用除颤仪电转复。如果转复失败则可控制心率、抗凝治疗，控制心率的药物包括倍他乐克、何贝爽及地高辛。目前提倡的宽松心率控制，是将活动时心率控制在110次/分以下。抗凝治疗包括华法令、达比加群、阿派沙班。服用华法令应注意监控凝血情况，INR应控制在2-3之间，以防止出血，达比加群与阿派沙班出血风险相对较小，不需常规监测凝血情况。