病原体侵入人体呼吸道以后，是否引起肺炎，需要综合几方面因素。第一方面是病原体的致病力，另一方面是人体的抵抗力，还有就是影响两者相互作用的其他因素。病原体方面的影响因素有病原体的侵入途径、与机体组织的亲和力、以及病原体侵入的数量、毒力、生长繁殖的速度等。机体的抵抗力包含局部抵抗力和全身抵抗力。局部的因素有纤毛的运动、上皮细胞表面的粘液屏障、上皮细胞之间的紧密连接、局部上皮细胞表面的抗体sIgA以及局部组织结构的完整性和微环境。全身因素包括细胞免疫和体液免疫。而影响病原体致病力大小和机体抵抗力强弱的因素还需要考虑当时的气候、环境、机体的意识状态和情绪、是否存在疲劳或合并有基础疾病等。
比如新型冠状病毒肺炎，当到新冠病毒侵入人体呼吸道之后可能致病，而当侵入消化道那就不太会致病。新冠病毒侵入人体呼吸道与上皮细胞表面特异性受体结合，侵入细胞后在细胞内生长繁殖。当病毒数量少的时候，可能会被呼吸道上皮不断运动的纤毛和粘液屏障阻碍，不能与上皮细胞表面的特异性受体结合那就不会致病。
当一个人发生新型冠状病毒肺炎以后，他的情绪反应可能会对机体的免疫力有所影响。如果能够坦然面对，那么人体的免疫力对于新冠病毒引起的损伤可能也是适度的。假如患者焦虑、紧张、恐惧超出一定的程度，机体的免疫调节系统可能也会作出过度的反应，从而加重对机体的损伤。