DNA甲基化分析可鉴别与早发型颅内动脉粥样硬化性狭窄相关的甲基化位点

作者：上海九院 神经内科  何欣威，崔国红，刘建仁

摘要

背景：颅内动脉粥样硬化性狭窄（ICAS）是重要的脑卒中的发病原因，特别是中国和东方人群中，ICAS的发病率更加高。其发病机制和病因的研究具有重要意义。ICAS和颅外动脉比较，发病的年龄更轻，和人种有关，因此可能和遗传或则表观遗传的关系更为密切。但是，研究表明遗传和环境因素不能解释颅内动脉粥样硬化性狭窄（ICAS）的所有风险和机制。DNA甲基化，一种重要的表观遗传因素，可能在ICAS的进展中起作用。

方法：首次用人甲基化试剂盒检测7例早期ICAS患者和7例完全匹配的对照组外周血白细胞DNA甲基化情况。然后，对甲基化基因进行功能分析。此外，在一个独立的队列中，对21名早期发病的ICAS患者和21名年龄和性别匹配的对照组进行了焦测序验证。

结果：根据已建立的标准，共发现318个CpG位点甲基化存在差异。功能分析解释了不同甲基化位点与动脉粥样硬化相关的过程和途径，如水解酶活性的负调节（go 0051346）、II型糖尿病（kegg hsa04930）和胰岛素信号传导途径（kegg hsa04910）。此外，我们还验证了RNF213基因中的差异甲基化位点CG22443212，与对照组相比，早发性ICAS患者的甲基化程度显著高于对照组（59.56（49.77，88.55）%比44.65（25.07，53.21）%，P=0.010）。受试者操作特征曲线分析表明，CG22443212曲线下面积为0.744（95%置信区间，0.586-0.866，P=0.002）。

结论：DNA甲基化的改变可能与ICAS的发生和发展有关。这些结果为ICAS提供了新的表观遗传学观点。

（上海九院 脑卒中中心 何欣威，崔国红，刘建仁；上述结果将发表于 Journal of Atherosclerosis and Thrombosis，2019）