真菌病的诊断相当困难，因真菌病多为继发感染，临床上的症状及体征常为原发病的表现。取痰或分泌物做涂片或培养，查到的真菌未必是致病菌。病人在同时或先 后常夹杂细菌病毒等感染，临床表现复杂，易误诊或漏诊。须结合临床有关材料，主要是具有“机会感染”因素的病人，如长期大量使用广谱抗生素、免疫抑制剂、 抗癌药等。痰、胸腔积液、脓中找到真菌孢子和（或）菌丝，及抗原皮肤试验，血清学检查有助于证实诊断。肺霉菌病肺部X线改变有以下几种：1、肺炎型：病灶发展快，呈现大片致密阴影。2、支气管肺炎型：治支气管分布的小片阴影或肺纹理明显增加，慢性病例有纤维化及肺气肿。3、肺脓肿型：由肺炎型演变或合并感染成脓肿，内可有透亮区或液平面。4、炎症肿块型：炎症肿块有纤维包膜包围，密度均匀，病程慢。5、混合型：曲菌球由曲菌丝和纤维黏液混合构成，寄生在肺内囊性病变中，如结核、囊性支扩等，菌球与囊腔间有气体存在，呈现一弯形空隙，有时还能随体位而转动，立位、平卧及侧卧位片上均可见到上方存在的空气影，这类患者常有咯血，是惟一X线改变有明显特点的真菌病。6、胸膜炎型：胸膜肥厚或有胸腔积液。