肛周脓肿多为化脓性感染，少数为特异性感染，后者又以结核杆菌感染多见，发病率为10%。肛周脓肿病程可分为三个阶段：感染期（初期）、成脓期（中期）、溃脓期（后期）。初期表现为肛周局部潮红、灼热、肿痛，并可伴有一系列全身症状。

在化脓性肛周脓肿感染期，保守治疗行之有效，无论是化脓性或是结核性脓肿治疗均应保守治疗为主，保守治疗包括中药内服、外敷，消炎药物的使用等方法。常用的中药方剂有：仙方活命饮、五神汤、五味消毒饮、青蒿鳖甲汤等。常用中药有金银花、野菊花、蒲公英、车前子、青蒿、知母等。外敷药有金黄膏、玉露膏、鱼石脂软膏等。消炎药物在感染初起早期使用足量，常能使感染病灶消散。即使在肛周脓肿破溃后形成肛瘘，在反复发作的感染期间，使用上述方法仍然有效。

值得指出的是，肛周脓肿成脓或将成脓，保守治疗已无意义，过多的使用消炎药物会妨碍脓肿的成熟，延误病程，应谨慎使用。该阶段治疗原则是：对症处理及支持疗法，对于高热不退患者可使用冰袋或酒精擦浴。食纳差者及时补充能量及大量维生素。排便困难者给予口服泻药帮助排便。明确成脓后早期切开引流。