舌咽神经痛类似感冒引起的扁桃体炎导致的痛，但痛得要比咽炎严重，类似电击或针刺样剧痛，阵发性发作，而不是炎症的持续性疼痛。这种疾病大多是由于异常血管的压迫舌咽及迷走神导致。通常在40岁以后发病，男女发病率差别不大，男性稍多，疼痛多发生在左侧，双侧疼痛者约占2％。中国医科大学航空总医院神经外科陈国强
舌咽神经痛的发病机制与原发性三叉神经痛相似，疼痛的程度也类似，疼痛如刀割、针刺、触电样，骤发，程度剧烈，历时数秒至1分钟不等，每天发作从几次至几十次。大多数有明显的发作期和静止期，有时静止期长达1年以上，但不会自愈，口服卡马西平可暂时缓解疼痛。可因吞咽、讲话、咳嗽、打呵欠、喷嚏、压迫耳屏、转动头部或舌运动等刺激诱发，疼痛多骤然发生，呈阵发性如电击、刀割、针刺、烧灼、撕裂样剧烈疼痛。

舌咽神经痛有原发性和继发性，原发性舌咽神经痛的病因，大多为血管挤压神经或炎症等因素导致舌咽及迷走神经的脱髓鞘性病变引起舌咽神经的神经纤维之间发生“短路”的结果。继发性舌咽神经痛可继发于各种舌咽神经周围的肿瘤、椎动脉硬化、动脉瘤、残留舌下动脉、蛛网膜炎、局部感染、茎突过长、茎突舌骨韧带骨化、舌咽神经颅外段的损伤、颈内动脉颅外端闭塞和颈外动脉狭窄致颈静脉孔附近的舌咽神经发生缺血性变化形成假性突触等，原因可能是小脑脑桥角或咽喉部肿瘤，颈部外伤，茎突过长茎突舌骨韧带骨化等压迫刺激舌咽神经而诱发。
舌咽神经根在进出脑桥处，即中枢与周围神经的移行区，有一段神经缺乏细胞的包裹平均长度2mm，简称脱髓鞘区，该部位血管搏动性压迫破坏了神经纤维之间的绝缘层即可出现舌咽神经分布区阵发性疼痛。造成舌咽神经根部受压的原因可能有多种，除血管因素外，还与小脑脑桥角周围的慢性炎症刺激有关，慢性刺激致蛛网膜炎性改变逐渐增厚使血管与神经根相互紧靠促成神经受压的过程。因为神经根部受增厚蛛网膜的粘连，动脉血管也受其粘连发生异位而固定于神经根部敏感区，致使神经受压和冲击而缺乏缓冲余地。

舌咽神经痛药物治疗多无效，应考虑手术治疗

舌咽神经的根丝，自延髓橄榄后沟前部出脑，与迷走神经和副神经同出颈静脉孔。在孔内神经干上有膨大的上神经节，出孔时又形成一稍大的下神经节。舌咽神经出颅后先在颈内动、静脉间下降，然后呈弓形向前，经舌骨舌肌内侧达舌根，分支有鼓室神经、颈动脉窦支、扁桃体支、茎突咽肌支、舌支、咽支。舌咽神经主管咽喉部粘膜的感觉，一部分唾液腺的分泌和舌后三分之一的味觉，与迷走神经一起主管咽喉部肌肉的运动，主要控制茎突咽肌、腮腺体、部分味蕾和收集来自耳部后部的感觉等，舌咽神经根部受压刺激或病变，不仅会引起疼痛，还会出现相应器官功能障碍。
舌咽神经痛如不给予治疗，一般不会自然好转，疼痛发作逐渐频繁，持续时间越来越长，严重影响病人的生活及工作。一般药物等保守治疗在发病初期可暂时缓解症状，使疼痛发作次数减少或减轻，少数症状可消失，但多数无效或一段时间复发。手术治疗有舌咽神经根切断术、微血管减压术。神经切断后疼痛虽然极少复发，但同侧舌后1/3味觉丧失，软腭扁桃体区及舌根部麻木，咽部干燥不适，轻软腭下垂及短暂性吞咽困难。微血管减压术不仅解除了疼痛，又保留了神经的完整，是治疗舌咽神经痛的最佳选择。显微血管减压术上世纪70年代末引进入国内，航空总医院神经外科中心在陈国强教授带领下，继承并创新性改进后，形成完善的治疗流程，治愈率稳定在99%以上，是目前最安全、有效的外科治疗方式。
一些生活因素，如饮食上的肉食过多、饮酒过多，再加上气候、环境污染、过度疲劳、生活不规律、精神刺激等，会促进血管病变，进一步诱发舌咽神经痛发作，应尽量节制饮食，合理作息。

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