近年来由于研究的不断进展，免疫抑制剂类药物，包括硫唑嘌呤、环孢素等大量应用于轻、中度激素依赖性或激素治疗无效的克罗恩病患者，对于控制肠道症状、肠道炎症有明显的效果。但是对于肠道狭窄、梗阻、穿孔、肛瘘、肠瘘等并发症以及后期接受手术治疗是否具有影响目前尚存在争议。

       2015年8月发表在《Alimentary Pharmacology and Therapeutics》杂志发表了一篇题目为Impact ofthe early use of immunomodulators or TNF antagonists on bowel damage andsurgery in Crohn’s disease的文章，作者来自瑞士伯尔尼大学。这篇文章主要介绍了关于早期使用免疫抑制剂可以降低肠道狭窄、肛瘘、肠瘘等并发症的发生率，但并不能降低后期手术的风险。

       一、早期使用免疫抑制剂治疗的患者发生肠道狭窄的比例明显低于晚期使用免疫抑制剂的患者，同时早期联合、单独使用抗TNF也具有降低肠道狭窄的风险。二、早期采用免疫抑制剂治疗的患者与晚期采用免疫抑制剂的患者相比较，早期治疗患者接受肠道手术的风险并没有降低。

       2016年9月发表在《Journal of Crohns and Colitis》杂志上一篇关于儿童早期应用免疫抑制剂的临床调查研究表示，儿童早期服用激素及免疫抑制剂增加了出现肠道狭窄、穿孔、梗阻等并发症的发生率，作者来自于韩国釜山派克医院。

       对于诊断克罗恩病的儿童及成年患者，使用免疫抑制剂对控制全身症状、肠道反应及肠道炎症具有一定的疗效，但使用免疫抑制剂后对肠道生理结构及功能的影响具有两面性。

       目前关于克罗恩病患者使用免疫抑制剂能否降低肠道并发症及后期手术风险，尚存在争议。