门诊上常能遇到吃药“灭菌”不成功的患者，特别是多次“灭菌”失败的患者，大家共同的问题就是：这个幽门螺杆菌（Hp）咋这么难灭？为啥总“灭”不掉呢？
Hp根除不成功既有细菌的因素，也有接受治疗的人本身的因素。一些因素非人力可控，但也有一些能避免的情况，应在接受治疗前、或治疗中，甚至治疗后引起足够的重视。
首先，细菌方面的因素。
Hp对抗生素产生耐药是导致根除失败最主要的原因。由于抗生素的普遍使用，根除Hp方案中最为常用的克拉霉素、甲硝唑、左氧氟沙星等的耐药率基本都在20%以上。另一常用抗生素阿莫西林的耐药率较低，报道认为不超过10%，但青霉素过敏的人就很难从中获益。一些不常用的抗生素，如四环素、呋喃唑酮（痢特灵）的耐药率低，不超过5%，被作为一线治疗失败后的补救治疗，但上述药物目前在城市中很难购买到，且药物的副作用相对较大，也限制了这些药物的使用。还有一些治疗感染的常用抗生素，比如莫西沙星，虽未被用于治疗Hp，但发现也有较高的耐药率（约10%）。这样大范围的对临床常用抗生素的耐药，有报道甚至是同时对两种或三种抗生素均发生耐药（称为多重耐药），不仅导致HP首次治疗的成功率下降（比如经典的三联x10天方案目前报道的根除率不到70%），也给后续再次或多次根除治疗造成了压力。
除了细菌耐药这一主要原因，还有大约50%的治疗失败不能用Hp耐药解释，而是与以下一些因素有关，比如：部分菌株（如cagA阴性、毒力较小的菌株）可能对抗菌药物不敏感；Hp定植在胃体窦交界的部位而非在胃体或胃窦；胃内细菌负荷量过高等，也会导致治疗失败。总体来说，细菌因素导致的治疗失败基本属于不可控因素。
其次，患者的因素。
因药物的不良反应（如恶心、呕吐、腹痛、腹泻、口苦、皮疹等）或用药疗程较长（目前疗程多为10-14天），有的患者服药依从性比较差，通常表现为：间断服药（想起来吃，忘了就算了）、自行停药、减少药量或用药品种、自行缩短疗程等。用药不规范很容易导致细菌耐药致使治疗失败。这一点其实是可以尽量避免的！在服药前做好服药计划（比如需要出差的话就先不服药，避免漏服），如出现不良反应觉得不能耐受，要及时去门诊咨询医生更改治疗方案。
还有一些患者方面的因素，比如：平素喜欢滥用抗生素；有吸烟、饮酒、暴饮暴食等不良习惯；口腔卫生习惯不佳，牙菌斑内有Hp定植；对质子泵抑制剂（英文简称PPI，比如奥美拉唑、雷贝拉唑等）存在快代谢的个体差异；机体免疫状态低下，也比较容易出现治疗失败。除了机体免疫力低下、对治疗药物的反应存在个体差异这样不可控因素外，平时不要滥用抗生素、戒烟戒酒、规律饮食、规律作息、注重口腔卫生等还是能够做到的。
目前认为根除治疗开始前2周内使用PPI或抗生素，可通过影响细菌活性而降低Hp的根除率。因此，在准备治疗时要停用PPI类抑酸药和抗生素至少2周。这一点也是可以提前做到的。
最后，还要强调一点。Hp即便根除成功也并非一劳永逸。如果生活环境的卫生条件比较差，也不注意养成良好的卫生习惯（如饭前便后不洗手、不注意分餐、餐具不干净、生熟食物混放、食物不清洗或烹饪不彻底、不刷牙等等），就很容易导致Hp的再感染。所以力所能及的改善卫生条件和习惯也是值得重视的。