治疗非酒精性脂肪性肝病，主要针对不同的危险因素，包括病因的治疗，饮食控制，运动疗法以及药物治疗，严重者还需要手术治疗。

针对原发病和危险因素给予治疗，比如说，减肥，合理控制血糖和血脂，纠正营养失衡。

控制饮食和适量运动是治疗的关键。

可以用于治疗非酒精性脂肪性肝病的药物，包括以下几类。第一，降血脂的药物，包括以降低甘油三酯为主的氯贝丁酯类，以降低胆固醇为主的HMG-CoA还原酶抑制剂，弹性酶。需要指出的是，由于这些降血脂的药物，多数都会对肝功能有一定的损害，因此，不伴有高脂血症的非酒精性脂肪性肝病患者，原则上不用降脂药物，伴有高脂血症的患者则在综合治疗的基础上应用降血脂的药物，但需要适当减量和监测肝功能，必要时联合应用保肝药物。腺苷蛋氨酸可用于脂肪肝的治疗。熊去氧胆酸，具有增加胆汁中脂质成分的分泌，膜稳定，细胞保护，抗凋亡及免疫调节等作用，可用于该病。还可以用一些抗氧化剂，包括维生素e，维生素a，还原型谷胱甘肽，水飞蓟宾，乙酰半胱氨酸等等。有胰岛素抵抗的患者，可以应用二甲双胍治疗。

还有一种治疗就是外科的手术治疗，包括减肥手术以及肝移植。非酒精性脂肪性肝病，发展到晚期肝硬化，肝功能衰竭，门脉高压及其并发症和肝癌，可危及患者生命，此时肝移植是抢救生命的唯一选择，然而非酒精性脂肪性肝病的患者肝移植后极易复发，并迅速从单纯性脂肪肝进展至脂肪性肝炎和肝硬化，其原因可能与遗传以及术后持续性高脂血症，糖尿病和糖皮质激素治疗等有关。