当磁共振、CT等影像学检查发现颅内病变时，仅靠影像学检查及医生经验，很难明确具体诊断，往往需要通过手术或活检获得病变标本，送病理检查，才能明确诊断，为下一步治疗方案的制定及预后判断提供依据。颅内病变可以通过开颅手术直视下活检或立体定向技术穿刺活检获得病变组织，由于前者方法手术创伤大、定位欠精准等问题，不适合颅内多发病变、脑深部、中线结构以及重要功能区病变，对于以上区域的病变，立体定向穿刺活检是获取颅内病变病理组织的最佳方式。随着影像技术及计算机3D技术等的发展，颅内病变立体定向活检技术已实现了血管、纤维束及重要脑功能区的3D可视化，术前可在计算机上模拟出穿刺道及血管、纤维束及重要脑功能区等相关结构，使穿刺道完美避开上述重要结构，保证手术的精准、安全。
立体定向微创活检的适应征主要有：
1.位于脑重要功能区或脑深部（胼胝体、基底节、鞍区、松果体区、脑干、中线区等部位）病变性质不明确，预计开颅手术将导致严重神经功能缺失，而又必须明确病变性质者。
2.颅内多发病变、弥漫性半球分布病变，不能明确病理性质，需要进行鉴别诊断，以便下一步正确治疗者。
3.疑为颅内炎性病变或者自身免疫性疾病颅内病变，如脱髓鞘病变、进行性多发性白质脑病、原发性中枢神经系统血管炎等，需得到病理学诊断，协助临床诊治者。
4.体质差、不能耐受或拒绝开颅切除手术，欲明确肿瘤性质，以决定放化疗方案者。
5.疑似淋巴瘤、生殖细胞瘤等对放化疗效果较好的肿瘤，需要病理学诊断或分级来指导拟行的放化疗及伽玛刀等治疗者。
6.需对脑肿瘤复发与放射性坏死做出鉴别诊断，以便下一步正确治疗者。