常有些患者在应用抗生素后，突然发生腹泻，大便带脓血，伴有腹胀，腹痛，严重者伴有脱水，电解质紊乱，甚至血压下降。个别病例还出现粪便中有粉红色黏膜样碎片，大小不一。于是有部分人开始精神不集中甚至精神恍惚。从其临床表现看，这些人很可能患了菌群失调症。

在我们人类胃肠道内寄居着种类繁多的微生物，这些微生物又称为肠道菌群，这些菌群约有400以上菌种，它们构成了一个巨大而复杂的生态系统。肠道菌群按一定比例组合，各菌之间相互制约，相互依存，在质和量上形成一种生态平衡。其生理学机能主要是：合成维生素、协助营养素的消化与吸收、产生糖皮质激素作用增强因子等，在机体感染防御中起一定作用。如果人体内外环境发生变化，特别是长期应用广谱抗生素后，敏感肠菌被抑制，未被抑制的细菌乘机繁殖，从而引起菌群失调。此外，长期食用无纤维食物，使肠道细菌易位，肠道菌群出现不平衡，也会导致菌群失调症的发生。菌群失调症往往出现结肠黏膜坏死与溃疡，这与长期应用广谱抗生素有关，有些抗生素可使某些细菌增殖，产生蛋白质毒素，因而破坏了肠黏膜，出现了系列腹泻症状。

一旦确诊菌群失调后，必须立即停用原抗生素，根据菌群分析以及药物敏感试验，选择合适的抗生素以抑制过度繁殖的细菌。并应用活菌制剂、菌群促进剂等进行治疗。必要时运用中医中药辨证治疗，以尽快消除症状，恢复健康。