经过研究发现胃大部切除术后胆囊结石的发病率比正常人要高出很多，就其发病机制来说目前还不是完全明确。经过个人多年的临床经验总结认为有以下几个方面的因素：
1.机械排空障碍：胃大部切除术中会切除患者2/3的胃，手术之后胃的容积变小，这直接导致了患者摄食量的减小，所以消化脂肪时需要的胆汁量变少，但是事实上肝脏合成的胆汁量并没有相应的减少，这种情况直接导致的结果就是生成胆汁的量相对过剩，与手术之前相比，胆囊内贮存的胆汁过剩，多余的胆汁就会被胆囊浓缩，经过浓缩之后胆囊之内胆固醇的浓度就会相对升高，主要呈现一种饱和或者过度饱和的状态。
2.体液分泌因素：因为胃大部切除术患者胃的大部分都被切除了，原有主细胞、具有分泌功能的壁细胞等都大量减少，所以分泌的胃酸、胃蛋白酶的量下降许多，胆囊收缩素等激素也相应减少。患者行毕II式胃大部切除术之后，或者进行全胃切除术之后，胃内的物质就不会经过十二指肠，直接进入到空肠，这将会对胆囊收缩素的释放产生严重的影响，最终的结果就是形成胆囊排空性障碍、胆道内压升高、Oddi括约肌痉挛等，胆囊内的胆汁排空发生延缓，最终导致胆囊内的胆汁浓缩、瘀滞、黏度增加，为胆囊结石的形成提供了便利条件。
3.神经损伤因素：首先，胃大部切除术会误伤胆支，导致十二指肠、胆管、胆囊平滑肌的运动收缩等功能会随之减退，胆囊中胆总管的运送功能也会随之减慢；因为受到Oddi括约肌交感神经的影响，胆囊处于一种极度兴奋的状态，兴奋中伴有紧张感，这时胆汁排出的过程中会受到一定阻碍，这样内存的胆汁量会变多，胆固醇会相应浓缩，最终形成胆固醇结石。其次，胃大部切除术后肠神经系统的功能会发生一定的改变。毕II式手术中会切断胃与十二指肠，这直接导致的结果就是肠神经系统功能受到损伤，胆汁排泄出现障碍，Oddi括约肌出现运动障碍，出现胆汁淤积，最终形成结石。
4.胆汁中肠肝循环因素：经过胃大部切除术后，患者的胃肠道会得到重建，原有的胃肠道生理解剖结构发生改变。与手术前相比，肠内食糜团明显减少，对胆汁的肠肝循环造成严重的影响，肠道之内消化食物之后剩余胆汁的量比以前增大，产生更多的胆汁重复吸收，胆囊的再贮存量逐渐增多，最终形成胆囊结石。
5.胆道逆行感染：患者经过胃大部切除术后，胃壁细胞的数目与以前相比明显减少。胃酸的主要功能之一就是杀灭十二指肠中的细菌，但是经过胃大部切除术之后这种功能逐渐降低甚至丧失。未经杀灭的细菌会使胆囊中的胆固醇和胆红素析出变成沉淀，胆汁的成分会因此发生改变，其黏度会明显升高，极易出现沉淀，最终出现结石。因为毕II式手术会将胃与十二指肠切断，Oddi括约肌的运动障碍会随之出现，这对于胆汁排泄来说是非常不利的，不仅如此，还为十二指肠胆汁的反流感染提供了条件，手术之后患者更容易出现胆道逆行感染，最终出现胆囊结石。
6.胆汁中的瘦素：从临床上来说，血清瘦素与胆结石具有非常明显的相关性。首先，胆囊壁上的受体会与胆汁中的瘦素相结合，帮助胆囊壁毛细血管中的血小板聚集在一起，演变成血栓，一旦出现血管痉挛，很容易会出现胆囊壁炎症。其次，在囊壁炎症修复的过程中，瘦素也是非常重要的因素，与成纤维细胞共同发生作用，非常容易形成细小的瘢痕组织，些瘢痕组织是囊壁运动功能降低的重要影响因素。最后，瘦素也是转变胆汁成分的重要因素，促进胆固醇过饱和胆汁的形成。
过胃大部切除术后患者应该怎么预防胆囊结石呢？主要是多检查，建议每半年做1次胆囊B超检查。如果有胆汁淤积的表现可以口服中药或融石的药物，还要合理调节饮食，日常饮食中注意多食酸类食物，低脂肪饮食。